祁门红茶的生产工艺特别精细，分为初级生产和精制两大工序。初级系统奠定品质基础，而精制系统将相对粗糙的毛茶升华为具有丰富精神和美感的上品。有四个初级工序，十几个精炼工序，近十个档次，几十种颜色，极其复杂精致。每一个动作都是孜孜不倦的重复和心血，是其他功夫红茶无法比拟的。因此，祁门红茶又被称为“祁门功夫红茶”，也是中国功夫红茶的代表。
一、采摘
祁门红茶采摘在春夏两季进行，最佳时间为4月5 ~ 15日，即清明节后谷雨前。此时茶树的第一片芽叶刚刚在春天发芽，此时的芽头是最新鲜最漂亮的。
过去用祁门红茶加工功夫茶，采摘标准主要是一芽二叶三叶。近几年开始做红毛峰、红蜗牛等清香型红茶，采摘越来越嫩。早春，越来越多的茶叶采摘一芽一叶，甚至单芽。
二、萎凋
采摘鲜叶后的第一步会开始以萎凋的方式进行，也就是将采摘的鲜叶摊晾，使叶片中的水分均匀流失，叶片枯萎死亡。
三、揉捻
鲜叶枯萎后，就要开始茶叶成型的第一步，揉捻。
通俗地说，揉面就是把枯叶像揉面一样揉成条状的过程。在揉捻过程中，重要的是打破茶叶中的细胞，使茶叶中的茶多酚与空气中的氧气接触，进行酶促氧化，为下一步发酵奠定基础，有利于红茶香气的形成。
四、发酵
如果说揉捻是祁门红茶品质的基础，那么发酵可以说是祁宏品质的关键。
发酵是制作红茶的关键步骤，也是红茶变红的决定性过程。只有扭曲的茶叶发酵后，绿茶的叶子才会逐渐变成红色，形成红茶独特的颜色、香气和味道。
五、烘干
最初准备的最后过程是干燥。通过高温烘焙，一方面终止酶活性，防止过度发酵；二是将茶叶中的水分干燥至7%以下，有利于茶叶的保鲜；三是丰富和发展香气。
干燥时在高温的作用下，散发出带有青草气的低沸点香气物质，同时糖类和氨基酸与糖类反应生成具有蜂蜜香气的物质，大量具有果香和花香的香气物质，如内酯、萜类和醇类，形成祁门红茶的香气特征。